Химический лицей учрежден в 1990 году Московским комитетом образования по инициативе Академии наук и Московского городского дворца пионеров и школьников (МГДПиШ).
Основная задача Лицея - обеспечение наиболее благоприятных условий для развития и самореализации личности, обладающей повышенными способностями и мотивацией к творческой (научно-исследовательской) деятельности в области естественных (химия, физика) и математических наук.
Продолжительность обучения в Лицее - 3 года (9-11 классы).
Совместными усилиями Московского комитета образования и Института органической химии создана уникальная, оснащенная современным оборудованием химическая лаборатория, где лицеисты осваивают технику и методологию проведения химического эксперимента и выполняют свои исследовательские проекты. Также в Лицее созданы стационарный (на платформе Intel) и несколько мобильных (на платформе Macintosh) компьютерных классов.
Особое внимание в Лицее уделяется общему образованию. Практически по всем основным общеобразовательным предметам, включая гуманитарные, реализуются углубленные, адаптированные к возможностям и потребностям творческой личности авторские программы.
Ежегодно учащиеся Лицея - в числе победителей московских, региональных, всероссийских и международных предметных олимпиад и научно-практических конференций.
Одним из важных аспектов деятельности Лицея является развитие индивидуальных творческих способностей учащихся. На сегодняшний день в Лицее действуют театральные студии, вокально-инструментальные группы, академический хор, симфонический камерный оркестр, школа классического вокала, кружки игры на акустической и электрогитарах.
В каникулы Лицей организует экологические, краеведческие, археологические и реставрационные экспедиции, в которых принимает участие большинство лицеистов. Маршруты проходили по следующим местам: озеро Байкал, Карпаты, Южный Урал, Кавказ, озера Псковской и Архангельской областей, Соловецкие острова, Кольский полуостров, Крым, Черноморское побережье Кавказа. Также организуются туристические поездки в Киев, Псков, Санкт-Петербург и другие.
100% выпускников Лицея продолжают образование в вузах (МГУ: факультеты химический, физический, механико-математический, вычислительной математики и кибернетики, наук о материалах и др.; РХТУ им. Д.И.Менделеева; ВХК РАН; МФТИ; МИФИ; МГТУ им. Н.Э.Баумана.).
В рамках Лицея работает межшкольный факультатив (8-11 классы), который обеспечивает возможность учащимся других школ города Москвы получить углубленную и систематическую подготовку по химии и математике.
Прием в Лицей осуществляется на конкурсной основе. Традиционно в марте проходит День Открытых Дверей.
Плата за обучение в Лицее, спонсорские и благотворительные взносы с родителей не взимаются, дополнительные платные образовательные услуги не оказываются, репетиторство не практикуется.